Jun_100k

李俊

上海交通大学|物理学博士|2023应届生|phyjun@sjtu.edu.cn

我博士期间的一些科研项目,主要是利用超高分辨率(纳米尺度)的单分子全内反射EMCCD显微镜,和借助开源的Linux计算机模拟软件,研究生物大分子(比如:蛋白质,DNA, RNA以及高分子)的动力学或热力学行为。最后从物理上统计力学、热力学等理论出发,提出物理模型给出合理的解释。

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教育经历

上海交通大学

  • 物理学 / 博士 / GPA 3.54/4

  • 荣誉奖项 / 物理天文学院2017年学术大会优秀海报奖、2018物理天文学院优秀助教

2016年9月-2022年12月

四川大学

  • 物理学 / 本科 / 排名3/45

  • 工商管理 / 本科双学位 / 排名8/119

2012年9月-2016年06月



项目经历

1. Jun Li, Xiaohu Hu, Thomas Neusius, Xiaolin Cheng, Micholas D. Smith, Aljaž Godec, Liang Hong, Ralf Metzler, Jeremy C. Smith*
Reply to: Insufficient evidence for ageing in protein dynamics

Nature Physics, 17, 775-776 (2021)

pdf


2. Jun Li, JingFei Xie, Aljaž Godec, Keith R. Weninger, Jeremy C. Smith, Liang Hong*
Non-ergodicity of a globular protein extending beyond its functional timescale

Chemical Science, under review

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3. Jun Li*
The role of ergodicity, aging to resolve the origin of molecules diffusion

PCCP, DOI: 10.1039/D2CP01161A

pdf


4. Jun Li, Xiaoyu Zhang, Liang Hong* & Yu Liu*
Entropic driven of Mg2+ induced RNA riboswitch folding

JPCB, under review

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5. Jun Li, Pan Tan, Runbang Li, Liang Hong*
Energy landscape of various macromolecules revealed by transition network analysis

To be submitted, in preparation

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6. Yanyan Xue, Jun Li (co-first author), Dian Chen, Xizhu Zhao, Liang Hong, Yu Liu*
Co-transcriptional folding of a nascent RNA at single-nucleotide and single-molecule resolution

To be submitted, in preparation


7. Pan Tan, Jun Li, Liang Hong*
Statistical properties for diffusive motion of hydration water on protein surface

Physica B: Condensed Matter, 562:1-5

pdf


8. Song Li, Pan Tan, Jun Li, Min Tang, and Liang Hong*
Many-body effect renders universal subdiffusion to water on different proteins

PRR, 4, L22003 (2022).

pdf


9. Zhuo Liu, Chenxing Yang, Juan Huang, Gaia Ciampalini, Jun Li, Victoria García Sakai, K. L. Ngai, and Liang Hong*
Direct Experimental Characterization of Contributions from Self-Motion of Hydrogen and from Interatomic Motion of Heavy Atoms to...

JPCB, 122.43 (2018): 9956-9961.

pdf




其他信息

1. 技巧技能:Matlab(★★★★)、Python(★★★)、Linux(★★★)、英语(CET-6)、Photoshop(★★★) 、Zemax(★★)
2. 社会实践:视觉中国签约摄影师(2019-),物理学习委员(2014-2016),工商管理班长(2013-2016),课程助教(2016-2021)

Jun_100k

李俊

上海交通大学|物理学博士|2023应届生

我博士期间的这些科研项目,主要是利用超高分辨率(纳米尺度),基于全内反射原理的单分子能量共振转移EMCCD显微镜;和借助开源的Linux计算机模拟软件,研究生物大分子(比如:蛋白质,DNA, RNA以及高分子)的动力学或热力学行为。最后从物理上统计力学、热力学等理论出发,提出物理模型给出合理的解释。

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教育经历

上海交通大学(2016.09 - 2022.12)

  • 物理学 / 博士 / GPA 3.54/4

  • 荣誉奖项 / 物理天文学院2017年学术大会优秀海报奖、2018物理天文学院优秀助教

  • 物理学 / 博士 / GPA 3.54/4

四川大学(2012.09 - 2016.06)

  • 物理学 / 本科 / 排名3/45

  • 工商管理 / 双学位 / 排名8/119


科研论文

1. Jun Li, Xiaohu Hu, Thomas Neusius, Xiaolin Cheng, Micholas D. Smith, Aljaž Godec, Liang Hong, Ralf Metzler, Jeremy C. Smith*
Reply to: Insufficient evidence for ageing in protein dynamics

Nature Physics, 17, 775-776 (2021)


2. Jun Li, JingFei Xie, Aljaž Godec, Keith R. Weninger, Jeremy C. Smith, Liang Hong*
Non-ergodicity of a globular protein extending beyond its functional timescale

Comm. physics, under review


3. Jun Li*
The role of ergodicity, aging to resolve the origin of molecules diffusion

PCCP, under review


4. Jun Li, Xiaoyu Zhang, Liang Hong* & Yu Liu*
Entropic driven of Mg2+ induced RNA riboswitch folding

JPCB, under review


5. Jun Li, Pan Tan, Runbang Li, Liang Hong*
Energy landscape of various macromolecules revealed by transition network analysis

To be submitted, in preparation


6. Yanyan Xue, Jun Li (co-first author), Dian Chen, Xizhu Zhao, Liang Hong, Yu Liu*
Co-transcriptional folding of a nascent RNA at single-nucleotide and single-molecule resolution

To be submitted, in preparation


7. Pan Tan, Jun Li, Liang Hong*
Statistical properties for diffusive motion of hydration water on protein surface

Physica B: Condensed Matter, 562:1-5


8. Song Li, Pan Tan, Jun Li, Min Tang, and Liang Hong*
Many-body effect renders universal subdiffusion to water on different proteins

Physical Review Research, 4, L22003 (2022).


9. Zhuo Liu, Jun Li, … Liang Hong*
Direct experimental characterization of contributions from self-motion of hydrogen and from interatomic motion of heavy atoms to protein anharmonicity

Journal of Physical Chemistry B, 122.43 (2018): 9956-9961.




其他信息

1. 技巧技能:Matlab(★★★★)、Python(★★★)、Linux(★★★)、英语(CET-6)、Photoshop(★★★) 、Zemax(★★)
2. 社会实践:视觉中国签约摄影师(2019-),物理学习委员(2014-2016),工商管理班长(2013-2016),课程助教(2016-2021)